业务系统运营的风险
即使SaaS开发商费尽辛苦，成功将SaaS实施于企业，接下来的问题还有不少，最主要的是SaaS系统的运营。如何保证应用系统的稳定性，如何保证网络通常，如何处理大量并发和海量数据，如何进行数据备份，这些都是开发商需要重点考虑的内容。
很显然，做到这么多要求需要投入大量维护成本，关键是这些成本是由谁来支付。SaaS开发商要想保证每一项关键业务应用都能达到99.999%的可靠性，使用普通的网络硬件设备几乎是不可能的。因此，SaaS的服务价格将有必要比传统ERP软件服务价格进行提高，而这种价格提升，对于企业来说几乎没有其他的选择。
一旦企业的SaaS业务系统全面运行，企业的命运就掌握在SaaS供应商的手里，企业必须不断支付费用才能得到SaaS服务商持续、稳定的服务，一旦SaaS服务商出现什么麻烦或风险，直接殃及企业自身的系统运行，企业必须被迫接受SssS供应商的报价。因此，企业在早期选购SaaS软件时，应当考虑到将来可能遇到的风险以及价格因素的变更。
数据安全性和隐私保护
企业ERP系统的数据的安全性和重要性往往至关重要，尤其是财务数据和客户信息，这些数据往往是一个软件企业的销售部门的核心机密，将这些至关重要的核心数据放在第三方的服务器上，对于当时大部分企业来说是无法接受的。特别是服务器和网络有时会遇到不可预知的故障，而如果一个企业进行关键业务的时候发生这些故障，那么这种服务就会被质疑。有能力的企业会考虑使用传统ERP软件的应用模式：购买软件、购买服务器、购买实施和服务。即使可能价格会较高，但某些敏感业务的稳定性可以得到保证。
在国外，即使一些大型网络公司，也无法保证其企业系统能够绝对可靠，比如国际网络巨头Google最近推出的以SaaS为模型的网络套装软件，提供了电子邮件、字处理和电子表格等功能，用于挑战微软的桌面办公工具软件Office。声势虽然比较浩大，但是在中国市场就肯定销售不出去。把企业邮件、文档等放在国外服务器上托管，即使普通用户都看得出巨大的风险：如果上不了邮箱系统怎么办，目前从中国访问Gmail邮件系统会经常断线(当然这也不全是该公司的责任，还有一些其他的复杂因素)，我们的企业经理如果有一封重要的邮件要发送，却发现无法访问Gmail邮箱，试问谁敢用这样的SaaS?
结论
就SaaS这种应用方式，对于某些特定企业来说可能有一定新意，但这种应用模式却不能适合所有企业，在实施、服务和运营过程中存在巨大的风险。也许，SaaS在企业ERP实施中只是一个梦想，有太多太多干扰因素，使得目前的SaaS是不能完美解决企业的实际应用。
因此，SaaS所面临的问题远远比通常想象的要复杂，SaaS软件也不仅仅是软件架构或者界面上的一点点修改就能解决目前的问题。这也就注定了当前SaaS的应用市场必定面向小型企业以及个人用户，对于中大型企业的实施应用SaaS软件，必定存在种种难以解决的问题和麻烦。而当前中国的SaaS供应商也很不完善，大型软件开发商是否有必要介入还心存疑问，当前SaaS供应商不少是由个人创业类型的人搞的，这些创业者没有资源、没有渠道，却有技术和热情，他们可以用最低的成本制作出最适合小企业使用的SaaS软件(有的会加上ERP或CRM的虚名)，还可以通过虚拟的网络扩大了自身的影响，通过媒体的炒作来获得企业的眼球。
然而我们应该注意到，SaaS在美国等发达国家也仅仅只是研究探索阶段，在国内的市场上成熟应用在短期内是极不现实的，更何况国内的ERP传统开发商已经在低端市场上竞争非常激烈了，SaaS供应商如果仅仅想依靠低价策略来获取这个低端市场的份额，我觉得SaaS的这种尝试难免会重蹈当年ASP的失败命运。
